{"id":1554,"date":"2019-09-06T20:04:04","date_gmt":"2019-09-06T18:04:04","guid":{"rendered":"https:\/\/sperimentando.com\/?p=1554"},"modified":"2023-09-24T18:38:33","modified_gmt":"2023-09-24T16:38:33","slug":"biodiversita-introduzione-alla-bioinformatica-per-studenti-della-scuola-media","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/sperimentando.com\/?p=1554","title":{"rendered":"biodiversit\u00e0 &#8211; introduzione alla bioinformatica per studenti della scuola media"},"content":{"rendered":"\n<h1 class=\"wp-block-heading\">Le sequenze di DNA contengono l&#8217;informazione per costruire gli organismi<\/h1>\n\n\n\n<p>Il DNA \u00e8 la molecola che contiene l&#8217;informazione genetica. Che cosa significa? Significa che tutto l&#8217;intero DNA che \u00e8 presente in ciascuna cellula di un organismo ha tutta l&#8217;intera informazione per costruire quell&#8217;organismo. A partire da quella informazione presente nella nostra prima cellula, lo zigote, la nostra intera persona \u00e8 stata costruita e siamo nati.<\/p>\n\n\n\n<p>Il DNA \u00e8 una molecola molto grande costituita da 4 tipi di mattoncini o monomeri che si mettono in fila uno dietro all&#8217;altro a formare una lunghissima molecola o polimero. Se questi quattro monomeri fossero lettere, mettendosi insieme uno dietro all&#8217;altro formerebbero delle lunghe parole. E quelle lunghe parole insieme farebbero un testo e il testo sarebbe il foglietto delle istruzioni per costruire un vivente. Questa metafora non \u00e8 poi molto lontana dalla realt\u00e0. I quattro tipi di monomeri sono i nucleotidi A, C, G e T e si mettono in fila a formare polimeri di DNA lunghi migliaia o milioni di nucleotidi. Quei polimeri sono la nostra informazione genetica.<\/p>\n\n\n\n<p>Possiamo quindi rappresentare questa informazione come una sequenza di lettere, o testo. I testi possono essere analizzati in vario modo utilizzando un computer e questo ci consente di capire cosa c&#8217;\u00e8 scritto nel libretto di istruzioni di ciascun vivente e di guardare quali viventi hanno istruzioni pi\u00f9 o meno simili.<\/p>\n\n\n\n<p>informazioni importanti per iniziare l&#8217;attivit\u00e0:<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\"><li>la sequenza del DNA di una cellula \u00e8 necessaria e sufficiente per\u00a0determina come funziona e come appare quella cellula. <\/li><li>la sequenza del DNA pu\u00f2 essere rappresentata come una sequenza di lettere,\u00a0ovvero\u00a0un testo, che possiamo studiare e analizzare con l&#8217;aiuto dell&#8217;informatica.<\/li><\/ul>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"240\" height=\"84\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2015\/10\/indovinachi.jpeg\" alt=\"indovinachi\" class=\"wp-image-486\"\/><\/figure>\n\n\n\n<p>Facciamo un gioco: indovina chi<\/p>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-image\"><figure class=\"alignright\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"300\" height=\"300\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2015\/10\/58703_3.jpg\" alt=\"che animale \u00e8?\" class=\"wp-image-489\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2015\/10\/58703_3.jpg 300w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2015\/10\/58703_3-150x150.jpg 150w\" sizes=\"auto, (max-width: 300px) 100vw, 300px\" \/><\/figure><\/div>\n\n\n\n<p>Vi fornir\u00f2 una sequenza di DNA, sar\u00e0 come avere una carta coperta che rappresenta l&#8217;animale, la pianta o il microbo che dovete indovinare. Facendo le giuste\u00a0domande riuscirete ad indovinare che apparenza ha e come \u00e8 fatto l&#8217;individuo nascosto. Immagino che abbiate gi\u00e0 giocato ad indovina chi no? questa sar\u00e0 la versione &#8220;zoo&#8221;, scopriamo chi si nasconde dietro la carta!<\/p>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-image\"><figure class=\"alignleft\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"1348\" height=\"899\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2015\/10\/A0123922_10_copia_large.jpg\" alt=\"che animale \u00e8?\" class=\"wp-image-490\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2015\/10\/A0123922_10_copia_large.jpg 1348w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2015\/10\/A0123922_10_copia_large-300x200.jpg 300w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2015\/10\/A0123922_10_copia_large-1024x683.jpg 1024w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2015\/10\/A0123922_10_copia_large-624x416.jpg 624w\" sizes=\"auto, (max-width: 1348px) 100vw, 1348px\" \/><\/figure><\/div>\n\n\n\n<p>Eccovi la carta incognita da mettere in testa: <a href=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2015\/10\/sequenzaDNAignota.txt\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\" aria-label=\" (si apre in una nuova scheda)\">sequenzaDNAignota.fasta<\/a><\/p>\n\n\n\n<p>Ecco come facciamo passo per passo a indovinare di chi si tratta:<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\"><li>apriamo il file con la sequenza e leggiamolo. <ul><li>Contiene una intestazione che dice &#8220;>gi|392841175|dbj|AB697520.1| porzione codificante di un gene proveniente da una analisi di laboratorio di Jun Sato:JS191&#8221;<\/li><li>e poi accapo, in una nuova riga, inizia una lunga parola fatta di una sequenza delle lettere A, T, C, G <\/li><\/ul><\/li><li>copiamo tutto (intestazione e sequenza) e usiamo un programma, chiamato &#8220;Blast&#8221;, \u00a0per confrontare la nostra sequenza con quelle conosciute e conservate nella banca dati delle sequenze di DNA note : <ul><li>cliccate <a rel=\"noreferrer noopener\" href=\"http:\/\/blast.ncbi.nlm.nih.gov\/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&amp;PAGE_TYPE=BlastSearch&amp;LINK_LOC=blasthome\" target=\"_blank\">su questo link per accedere al programma blast on line<\/a><\/li><li>incollate la vostra sequenza nella finestra in alto&#8221;Enter accession number(s), gi(s), or FASTA sequence(s)&#8221;<\/li><li>quindi scegliete di cercare nella banca dati che contiene tutte le sequenze di nucloetidi (\u00e8 l&#8217;impostazione standard, non occorre modificare niente)<\/li><li>cliccate infondo a sinistra sul bottone &#8220;BLAST&#8221; e attendete il risultato <\/li><\/ul><\/li><li>ora leggiamo insieme il risultato del blast e cerchiamo di rispondere a queste domande:<\/li><\/ul>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-image\"><figure class=\"alignleft\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"1013\" height=\"620\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-16.16.09.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-1560\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-16.16.09.png 1013w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-16.16.09-300x184.png 300w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-16.16.09-768x470.png 768w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-16.16.09-950x581.png 950w\" sizes=\"auto, (max-width: 1013px) 100vw, 1013px\" \/><figcaption>la pagina col vostro risultato dovrebbe avere questo aspetto e il secondo allineamento (quello selezionato) \u00e8 proprio la vostra sequenza, al 100% identica<\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n\n<p>Se leggiamo i risultati, e in particolare il secondo risultato, che \u00e8 identico al 100% (colonna &#8220;Per. ident&#8221;), troviamo molte utili informazioni.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"968\" height=\"23\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/selezione.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-1562\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/selezione.png 968w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/selezione-300x7.png 300w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/selezione-768x18.png 768w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/selezione-950x23.png 950w\" sizes=\"auto, (max-width: 968px) 100vw, 968px\" \/><\/figure>\n\n\n\n<p><strong>Ailurus fulgens<\/strong> \u00e8 il nome dell&#8217;organismo al quale questa sequenza di DNA appartiene.<\/p>\n\n\n\n<p><strong>Tas1r1<\/strong> \u00e8 il nome di quel particolare pezzetto di DNA (l&#8217;intero DNA di Ailurus fulgens \u00e8 molto molto pi\u00f9 lungo)<\/p>\n\n\n\n<p>la funzione di quel pezzetto di DNA \u00e8 &#8220;<strong>taste receptor<\/strong>&#8220;, una espressione in inglese che forse sai tradurre o magari sai usare google translate..<\/p>\n\n\n\n<p>scoprirai che significa &#8220;recettore del gusto&#8221; ovvero la sua funzione \u00e8 quella di contenere le istruzioni per costruire una struttura in grado di far sentire un particolare gusto.<\/p>\n\n\n\n<p>Ora prova a rispondere alle seguenti domande e scrivi le risposte in un file utilizzando un editor di testo semplice. (Se usi un sistema operativo di tipo windows cerca nel tuo computer il programma &#8220;blocco note&#8221;)<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\"><li>c&#8217;\u00e8 una sequenza identica alla nostra nella banca dati?<\/li><li>che funzione ha quel pezzettino di DNA?<\/li><li>qual&#8217;\u00e8 il nome scientifico dell&#8217;organismo a cui appartiene?<\/li><li>qual \u00e8 il suo nome comune? (se non lo sai, cercalo su una enciclopedia online che sia affidabile)<\/li><li>questo organismo ha i baffi? e\u00a0gli occhiali? \u00e8 pelato? (se non lo sai prova a cercare online le foto di questo organismo, stai attento a selezionare i risultati, controlla che vengano da siti affidabili e che rappresentino proprio l&#8217;organismo che stai cercando)<\/li><\/ul>\n\n\n\n<p>Se il gioco vi \u00e8 piaciuto potete ripeterlo con questa <a href=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/carta2medie.txt\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\" aria-label=\" (si apre in una nuova scheda)\">nuova carta<\/a>, sempre utilizzando <a rel=\"noreferrer noopener\" aria-label=\"blast (si apre in una nuova scheda)\" href=\"https:\/\/blast.ncbi.nlm.nih.gov\/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&amp;PAGE_TYPE=BlastSearch&amp;LINK_LOC=blasthome\" target=\"_blank\">blast<\/a>, le procedure sono le stesse e queste saranno le domande:<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\"><li>c&#8217;\u00e8 una sequenza identica alla nostra nella banca dati?<\/li><li>a quale organismo appartiene questa sequenza?<\/li><li>a che famiglia di organismi appartiene il nostro organismo ignoto?<\/li><li>da quale regione del mondo proviene?<\/li><li>quale caratteristica di questo organismo \u00e8 particolarmente apprezzata nella nostra societ\u00e0?<\/li><\/ul>\n\n\n\n<p>La <a rel=\"noreferrer noopener\" href=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2015\/10\/sequenzaDNAignota2.txt\" target=\"_blank\">terza ed ultima carta<\/a> di questo turno di gioco vi far\u00e0 scoprire degli organismi molto belli e molto diffusi, vediamo se usando <a rel=\"noreferrer noopener\" href=\"https:\/\/blast.ncbi.nlm.nih.gov\/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&amp;PAGE_TYPE=BlastSearch&amp;LINK_LOC=blasthome\" target=\"_blank\">blast<\/a> sarete in grado di identificarli e, leggendo i risultati, sarete poi in grado di rispondere alle domande che seguono:<\/p>\n\n\n\n<p>(piccolo suggerimento per leggere e capire il risultato: Leggendo l&#8217;intestazione del file vedrete che si tratta della sequenza di un &#8220;organismo marino non in coltura&#8221; pertanto ci aspettiamo che il risultato dica, in inglese, &#8220;uncultured [nome organismo] clone&#8221;. L&#8217;informazione che serve a voi \u00e8 il nome dell&#8217;organismo)<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\"><li>c&#8217;\u00e8 una sequenza identica alla nostra nella banca dati?<\/li><li>a quale grande gruppo di organismi appartiene il nostro organismo ignoto?<\/li><li>sapreste\u00a0trovare qualche immagine degli organismi di questa classe in rete?<\/li><\/ul>\n\n\n\n<h1 class=\"wp-block-heading\">I fossili ci raccontano la storia e la distribuzione geografica della vita sulla Terra<\/h1>\n\n\n\n<p>Dopo aver utilizzato la banca dati delle sequenze di DNA ora impariamo insieme ad utilizzare una nuova banca dati: quella dei fossili ritrovati e studiati nel mondo.<\/p>\n\n\n\n<p>La\u00a0<a rel=\"noreferrer noopener\" href=\"https:\/\/paleobiodb.org\/navigator\/\" target=\"_blank\">Banca dati di reperti fossili<\/a> \u00e8 accessibile in vari modi, uno dei quali \u00e8 la finestra di navigazione che consente di localizzare i siti dei ritrovamenti sulla mappa del globo terrestre e di selezionare anche la tipologia dei ritrovamenti, nonch\u00e9 di visualizzare l&#8217;aspetto della superficie terrestre all&#8217;epoca in cui pensiamo gli organismi trovati nei\u00a0reperti fossero in vita. Andiamo per gradi e vediamo insieme, una per volta queste funzioni.<\/p>\n\n\n\n<ol class=\"wp-block-list\"><li>iniziamo a fare pratica con le modalit\u00e0 di visualizzazione:<\/li><\/ol>\n\n\n\n<p>la <a href=\"https:\/\/paleobiodb.org\/navigator\/\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">schermata iniziale<\/a>&nbsp;apparir\u00e0 come l&#8217;immagine qui sotto<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image\"><a href=\"https:\/\/paleobiodb.org\/navigator\/\"><img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot1.png\" data-fslightbox=\"gallery1\"><\/a><\/figure>\n\n\n\n<p>facendo doppio clic su un periodo o un&#8217;era geologica la mappa tematica rimane invariata ma la scala dei tempi geologici cambia e viene visualizzato in dettagli il periodo che ho scelto. Ad esempio se io clicco due volte sulla barra &#8220;Jurassic&#8221;, la schermata apparir\u00e0 come qui sotto<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"1440\" height=\"656\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot2.png\" alt=\"paleoBioDB_screenshot2\" class=\"wp-image-787\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot2.png 1440w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot2-300x137.png 300w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot2-768x350.png 768w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot2-1024x466.png 1024w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot2-624x284.png 624w\" sizes=\"auto, (max-width: 1440px) 100vw, 1440px\" \/><\/figure>\n\n\n\n<p>possiamo spostarci liberamente nella scala dei tempi con il doppio click per esplorare il dettaglio di ogni era e il quadro generale di riferimento.<\/p>\n\n\n\n<p>Cliccando invece una sola volta sulla barra che rappresenta un certo intervallo di tempo, sulla mappa tematica del globo verranno visualizzati i ritrovamenti fossili di organismo che pensiamo siano vissuti in quell&#8217;intervallo di tempo. Se ad esempio clicco una sola volta sulla barra &#8220;Jurassic&#8221; la mappa apparir\u00e0 come l&#8217;immagine qui sotto, con i soli ritrovamenti di epoca giurassica. La barra delle ere geologiche sottostante mantiene l&#8217;aspetto che aveva prima del mio singolo click. A lato della mappa (in basso a sinistra) appare un box che dice che ho applicato un filtro ai dati, e il filtro in questo caso \u00e8 &#8220;Jurassic&#8221;. Impareremo ad utilizzare sempre pi\u00f9 filtri e li vedremo elencati in questo box. Da questo box stesso, cliccando sulla x potremo anche eliminarli.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"1437\" height=\"654\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot3.png\" alt=\"paleoBioDB_screenshot3\" class=\"wp-image-788\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot3.png 1437w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot3-300x137.png 300w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot3-768x350.png 768w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot3-1024x466.png 1024w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot3-624x284.png 624w\" sizes=\"auto, (max-width: 1437px) 100vw, 1437px\" \/><\/figure>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-image\"><figure class=\"alignright\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"103\" height=\"305\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot5.png\" alt=\"paleoBioDB_screenshot5\" class=\"wp-image-798\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot5.png 103w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot5-101x300.png 101w\" sizes=\"auto, (max-width: 103px) 100vw, 103px\" \/><\/figure><\/div>\n\n\n\n<p>La barra sulla destra mostra la percentuale di organismi appartenenti a ciascun grande gruppo tassonomico fra quelli selezionati (la selezione che avete fatto in questo caso \u00e8 per periodo). Cliccando sul simbolo di ciascun gruppo \u00e8 possibile espandere la visualizzazione dei dati vedendo le percentuali di presenza di gruppi pi\u00f9 specifici all&#8217;interno del grande gruppo selezionato. Clicckare per credere!<\/p>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-image\"><figure class=\"alignleft\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"67\" height=\"314\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/barraAS.png\" alt=\"barraAS\" class=\"wp-image-791\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/barraAS.png 67w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/barraAS-64x300.png 64w\" sizes=\"auto, (max-width: 67px) 100vw, 67px\" \/><\/figure><\/div>\n\n\n\n<p>La barra in alto a sinistra ci consente di modificare le modalit\u00e0 di visualizzazione dei dati che abbiamo selezionato. I simboli + e &#8211; ci consentono di ingrandire e rimpicciolire (zoom in e zoom out). Provate ad ingrandire e spostarvi sulla mappa. Provate anche, una volta ingrandito a passare il cursore sopra ai puntini che rappresentano i siti di ritrovamento e clickate sopra uno di questi. Si aprir\u00e0 un utilissima finestra di dialogo che vi fornisce i dettagli e le referenze di cosa \u00e8 stato trovato nel sito. L&#8217;immagine che segue \u00e8 un esempio di quello che potreste trovare.<\/p>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-image\"><figure class=\"aligncenter\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"1388\" height=\"641\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot4.png\" alt=\"paleoBioDB_screenshot4\" class=\"wp-image-792\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot4.png 1388w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot4-300x139.png 300w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot4-768x355.png 768w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot4-1024x473.png 1024w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/paleoBioDB_screenshot4-624x288.png 624w\" sizes=\"auto, (max-width: 1388px) 100vw, 1388px\" \/><\/figure><\/div>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"42\" height=\"40\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/Screen-Shot-2016-05-28-at-12.22.38.png\" alt=\"bottone1\" class=\"wp-image-793\"\/><\/figure>\n\n\n\n<p>Ora torniamo alla mappa e facciamo zoom out. La disposizione delle terre emerse che vedete \u00e8 quella attuale e non necessariamente corrisponde alla disposizione delle placche di crosta terrestre al momento in cui gli organismi ritrovati vivevano. Per avere una idea pi\u00f9 chiara di dove si trovassero, cliccate sul simbolo&nbsp;&nbsp;e la carta del globo mostrer\u00e0 l&#8217;aspetto della superficie relativo all&#8217;epoca a cui ci stiamo interessando. Ovviamente, se scegliamo un intervallo di tempo molto grande, nel quale la superficie terrestre avr\u00e0 cambiato pi\u00f9 volte aspetto, questa funzione non restituir\u00e0 nessun risultato perch\u00e9 non saprebbe quale carta mostrare. Per tornare alla visualizzazione tradizionale basta clicckare di nuovo sul simbolo&nbsp;&nbsp;per deselezionarlo.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"46\" height=\"39\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/bottone2.png\" alt=\"bottone2\" class=\"wp-image-794\"\/><\/figure>\n\n\n\n<p>Il bottone successivo \u00e8 la coccinella che vi consente di selezionare su quali organismi volete ritrovare informazioni utilizzando il loro nome tassonomico. Facciamo una prova e cerchiamo i felini (famiglia Felidae) in una qualsiasi era geologica di vostro interesse. Vedrete apparire i soli puntini relativi ai ritrovamenti di felini, se ce ne sono. Spostatevi pure nella scala dei tempi per scoprire quali sono le pi\u00f9 antiche testimonianze fossili che abbiamo della presenza dei felini. Magari fate anche zoom in e guardate quali sono i primi felini di cui abbiamo traccia in Italia. (Provate a vedere chi c&#8217;era a Verona nel quaternario.. !) Se volete andate anche in un ulteriore dettaglio e cercate la prima testimonianza fossile della presenza di gatti da compagnia (Felis silvestris). Per gli appassionati di cani il nome del genere \u00e8 &#8220;Canis&#8221; e il nome della specie \u00e8 &#8220;Canis lupus&#8221;.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"39\" height=\"39\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/bottone4.png\" alt=\"bottone4\" class=\"wp-image-800\"\/><\/figure>\n\n\n\n<p>L&#8217;ultimo bottone della barra \u00a0mi consente di salvare i dati che ho selezionato in vario modo, di fatto posso esportare\u00a0una porzione di banca dati, che posso aprire con un foglio di calcolo come excel di microsoft.<\/p>\n\n\n\n<h1 class=\"wp-block-heading\">A caccia dei fossili di animali davvero fantastici<\/h1>\n\n\n\n<p>Nella\u00a0<a rel=\"noreferrer noopener\" href=\"https:\/\/paleobiodb.org\/navigator\/\" target=\"_blank\">Banca dati di reperti fossili<\/a> ora cercheremo gli organismo del periodo Cambriano. Clickate una sola volta sulla barra del tempo sulla casella &#8220;Cambrian&#8221; in verde.<\/p>\n\n\n\n<p>Vedrete che sono stati ritrovati molti fossili nelle coste Americane, in Australia, Cina Russia e Europa occidentale. <\/p>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-image\"><figure class=\"alignleft is-resized\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/05\/Screen-Shot-2016-05-28-at-12.22.38.png\" alt=\"bottone1\" class=\"wp-image-793\" width=\"28\" height=\"26\"\/><\/figure><\/div>\n\n\n\n<p>Ora clickate sul simbolo che consente di visualizzare la distribuzione geografica delle terre emerse nel periodo cambiriano. In quale area geografica e fascia climatica vivevano gli organismi del cambriano che abbiamo ritrovato?<\/p>\n\n\n\n<p>Ora clickate sul simbolo a forma di coccinella e cercate &#8220;Anomalocaris&#8221;. Scegliete &#8220;Anomalocaris (genus)&#8221; e accertatevi che i filtri ora siano &#8220;Cambrian&#8221; e &#8220;Anomalocaris&#8221; come nella figura seguente.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"494\" height=\"458\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-18.49.40.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-1572\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-18.49.40.png 494w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-18.49.40-300x278.png 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 494px) 100vw, 494px\" \/><\/figure>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-image\"><figure class=\"alignleft\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"215\" height=\"155\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/anomalocarisD1-2.gif\" alt=\"\" class=\"wp-image-1575\"\/><\/figure><\/div>\n\n\n\n<p><a href=\"https:\/\/naturalhistory2.si.edu\/paleobiology\/burgess\/anomalocaris.html\">Anomalocaris<\/a> era uno dei pi\u00f9 temuti predatori dei mari del Cambriano di cui abbiamo notizia: era lungo da 1 a 2 metri e doveva apparire enorme alle sue prede, che ci risultano molto molto pi\u00f9 piccole! Aveva grandi occhi e due appendici davanti alla bocca per catturare e trattenere le prede, i denti erano cos\u00ec forti e aguzzi che potevano chiudersi come tronchesi e spezzare l&#8217;esoscheletro di artropodi o altre prede.  <\/p>\n\n\n\n<p>In quali regioni della Terra attuale abbiamo trovato i fossili di questo antico organismo? <\/p>\n\n\n\n<p>C&#8217;\u00e8 qualcosa che ti colpisce nella attuale localizzazione dei suoi resti?<\/p>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-image\"><figure class=\"alignleft\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"250\" height=\"108\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/waptiaD1.gif\" alt=\"\" class=\"wp-image-1576\"\/><\/figure><\/div>\n\n\n\n<p>Vi presento un crostaceo davvero curioso, si chiama Waptia. Controllate la localizzazione dei sui fossili, secondo voi, doveva preoccuparsi di scappare dal temibile Anomalocaris?<\/p>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-image\"><figure class=\"alignright\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"213\" height=\"90\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/opabiniaD1-1.gif\" alt=\"\" class=\"wp-image-1580\"\/><\/figure><\/div>\n\n\n\n<p>Se questi organismi vi sono sembrati un po&#8217; strani, il meglio deve ancora arrivare, Opabinia aveva 5 occhi, e una proboscide con una chela in cima, che probabilmente gli consentiva di afferrare i vermi che spuntavano dai fondali. <\/p>\n\n\n\n<p>Dove abbiamo trovato i fossili di quello che a molti, sulle prime, sembro uno scherzo invece che una scoperta?<\/p>\n\n\n\n<p>Cercando questi organismi, dovreste aver individuato due aree in cui tutti e tre sono presenti: una in Canada, vicina al confine con gli Stati Uniti e una in Cina. Il sito canadese si chiama &#8220;Burgess shale&#8221; e quella che vi mostro \u00e8 una verosimile foto di gruppo degli organismi che si trovavano l\u00ec circa 500 milioni di anni fa.<\/p>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-image\"><figure class=\"aligncenter\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"500\" height=\"367\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/reconstructionD2.jpg\" alt=\"\" class=\"wp-image-1577\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/reconstructionD2.jpg 500w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/reconstructionD2-300x220.jpg 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 500px) 100vw, 500px\" \/><figcaption>Ricostruzione disponibile con spiegazioni al seguente link: <a href=\"https:\/\/naturalhistory2.si.edu\/paleobiology\/burgess\/cambrianWorld.html\">https:\/\/naturalhistory2.si.edu\/paleobiology\/burgess\/cambrianWorld.html<\/a><\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n\n<p>Sappiamo che in quel periodo la vita sulla Terra era fitta e multiforme, almeno in alcune zone. Le forme di vita dell&#8217;epoca ci appaiono molto curiose perch\u00e9 gli organismi di oggi sono gli eredi solo di una piccola parte di loro, sono i figli di quelli che ce l&#8217;hanno fatta a passare le proprie istruzioni, il proprio DNA, alle generazioni successive.<\/p>\n\n\n\n<h1 class=\"wp-block-heading\">Con chi avevano a che fare i miei antenati?<\/h1>\n\n\n\n<p>Sappiamo che nel quaternario (che \u00e8 il periodo geologico pi\u00f9 recente, quello che arriva fino ad oggi) l&#8217;uomo \u00e8 stato ed \u00e8 presente in Italia. Io sono cresciuta ad Orvieto e ho deciso di guardare la cartina dei fossili ritrovati vicino a casa mia in epoche in cui l&#8217;uomo era certamente presente (come ho fatto ad esserne certa? prima ho cercato sulla carta usando come filtri <em>Homo sapiens<\/em> e quaternario e poi ho eliminato il filtro <em>Homo sapiens<\/em> per visualizzare tutte le presenze di quel periodo).<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"665\" height=\"374\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-19.43.08.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-1581\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-19.43.08.png 665w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-19.43.08-300x169.png 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 665px) 100vw, 665px\" \/><\/figure>\n\n\n\n<p>Cliccando sui siti fossiliferi vicini a Todi e a Marsciano, ho scoperto che gli antichi abitanti di questa regione potrebbero aver incontrato, fra gli altri, rinoceronti ed elefanti!! Quello che ho trovato \u00e8 mostrato nei due screenshot che seguono.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"518\" height=\"394\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-19.43.29.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-1582\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-19.43.29.png 518w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-19.43.29-300x228.png 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 518px) 100vw, 518px\" \/><\/figure>\n\n\n\n<p><\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"374\" height=\"580\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-19.43.44.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-1583\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-19.43.44.png 374w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-19.43.44-193x300.png 193w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-19.43.44-300x465.png 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 374px) 100vw, 374px\" \/><\/figure>\n\n\n\n<p>Dove abitate voi, quali interessanti organismi occupavano quell&#8217;area prima che arrivasse l&#8217;uomo o quando i vostri antenati si sono insediati?<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Le sequenze di DNA contengono l&#8217;informazione per costruire gli organismi Il DNA \u00e8 la molecola [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":1585,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"jetpack_post_was_ever_published":false,"_jetpack_newsletter_access":"","_jetpack_dont_email_post_to_subs":false,"_jetpack_newsletter_tier_id":0,"_jetpack_memberships_contains_paywalled_content":false,"_jetpack_memberships_contains_paid_content":false,"footnotes":"","jetpack_publicize_message":"","jetpack_publicize_feature_enabled":true,"jetpack_social_post_already_shared":true,"jetpack_social_options":{"image_generator_settings":{"template":"highway","default_image_id":0,"font":"","enabled":false},"version":2}},"categories":[295,4,1],"tags":[15,254,16,64],"class_list":["post-1554","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-featured-articles","category-ragazzi","category-tutto","tag-bioinformatica","tag-cambriano","tag-dna","tag-paleontologia"],"jetpack_publicize_connections":[],"jetpack_featured_media_url":"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2019\/09\/Screen-Shot-2019-09-06-at-20.03.02.png","jetpack_sharing_enabled":true,"jetpack_shortlink":"https:\/\/wp.me\/p5Zhdi-p4","jetpack_likes_enabled":true,"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/sperimentando.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1554","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/sperimentando.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/sperimentando.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/sperimentando.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/sperimentando.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=1554"}],"version-history":[{"count":10,"href":"https:\/\/sperimentando.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1554\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1586,"href":"https:\/\/sperimentando.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1554\/revisions\/1586"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/sperimentando.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/media\/1585"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/sperimentando.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=1554"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/sperimentando.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=1554"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/sperimentando.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=1554"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}