{"id":704,"date":"2016-02-09T17:53:14","date_gmt":"2016-02-09T16:53:14","guid":{"rendered":"https:\/\/sperimentando.com\/?p=704"},"modified":"2023-09-24T18:40:27","modified_gmt":"2023-09-24T16:40:27","slug":"introduzione-alla-chimica-del-carbonio-e-ai-gruppi-funzionali-nelle-molecole-biologiche","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/sperimentando.com\/?p=704","title":{"rendered":"Introduzione alla chimica del carbonio e ai gruppi funzionali nelle molecole biologiche"},"content":{"rendered":"<p>Studieremo insieme le molecole che si trovano dentro le cellule, quelle che caratterizzano la vita. Ma prima di iniziare a vederle in dettaglio, guardiamo insieme le caratteristiche fondamentali di alcune molecole un po&#8217; pi\u00f9 semplici, cos\u00ec quando poi metteremo insieme le parti che compongono le macromolecole sar\u00e0 pi\u00f9 facile immaginarne le caratteristiche.<\/p>\n<p>Quello che vi racconto in questa pagina e su cui abbiamo ragionato insieme in classe \u00e8 descritto velocemente sul vostro libro. Per ciascuno dei gruppi funzionali cercheremo adesso di capire alcune caratteristiche. Questo ci aiuter\u00e0 a capire meglio le caratteristiche delle macromolecole biologiche che incorporano uno o pi\u00f9 di ciascun tipo di gruppi funzionali.<\/p>\n<h3>Acqua<\/h3>\n<p>Per prima cosa ci siamo concentrati su una caratteristica della <span style=\"text-decoration: underline;\">molecola di acqua<\/span>: il fatto che il legame fra ossigeno e idrogeno \u00e8 un <span style=\"text-decoration: underline;\">legame covalente polare<\/span>, fra l&#8217;ossigeno che \u00e8 pi\u00f9 elettronegativo (3,5) e l&#8217;idrogeno che lo \u00e8 meno (2,1).<\/p>\n<div class=\"page\" title=\"Page 6\">\n<div class=\"section\">\n<div class=\"layoutArea\">\n<div class=\"column\">\n<div id=\"attachment_710\" style=\"width: 246px\" class=\"wp-caption alignleft\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" aria-describedby=\"caption-attachment-710\" class=\"wp-image-710 size-full\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/H2O_polarity.png\" alt=\"H2O_polarity\" width=\"236\" height=\"239\" \/><p id=\"caption-attachment-710\" class=\"wp-caption-text\">Le regioni colorate in rosso corrispondono alle zone di maggiore elettronegativita\u0300, mentre quelle colorate in verde e\u00a0blu\u00a0corrispondono alla minore elettronegativita\u0300.<\/p><\/div>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<ul>\n<li>Poich\u00e9 la molecola di acqua \u00e8 polare (cio\u00e8 ha delle zone parzialmente cariche + e altre parzialmente cariche -), le molecole di acqua tenderanno a disporsi fra di loro in modo tale che le regioni a parziale carica opposta siano vicine<\/li>\n<li>grazie a queste interazioni fra molecole polari l&#8217;acqua \u00e8 liquida a temperatura ambiente<\/li>\n<li>e ha una notevole\u00a0&#8220;tensione superficiale&#8221;\u00a0ovvero le molecole dell&#8217;acqua tendono a stare fra di loro piuttosto che a interagire con quelle di un altro materiale a contatto (per questo una gocciolina versata sul banco\u00a0\u00e8 bella sferica, ricordate?)<\/li>\n<\/ul>\n<\/div>\n<\/div>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h2>Gruppi funzionali:<\/h2>\n<h3>Carbonio e idrogeno<\/h3>\n<p>Carbonio e idrogeno hanno elettronegativit\u00e0 abbastanza simile (carbonio 2,5 e idrogeno 2,1). Le molecole che contengono carbonio legato ad altro carbonio o carbonio legato a idrogeno sono caratterizzate da legami covalenti apolari o poco polari, le molecole che ne derivano di conseguenza sono<span style=\"text-decoration: underline;\"> apolari<\/span>.<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\" wp-image-714 alignleft\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/ch4.jpg\" alt=\"ch4\" width=\"517\" height=\"134\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/ch4.jpg 332w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/ch4-300x78.jpg 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 517px) 100vw, 517px\" \/>Avevamo visto ad esempio il metano che \u00e8 apolare, come vedete nell&#8217;immagine a fianco la molecola \u00e8 tutta verde.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>questa \u00a0immagine di seguito vi mostra un confronto fra metano e acqua in cui si vede chiaramente che il metano \u00e8 apolare e a temperatura ambiente le molecole sono distanti fra loro, infatti \u00e8 un gas. L&#8217;acqua al contrario \u00e8 polare, le molecole intergiscono fra di loro e a temperatura ambiente \u00e8 un liquido.\u00a0<img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\" wp-image-713 aligncenter\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/methanewater1.gif\" alt=\"methanewater1\" width=\"495\" height=\"374\" \/>Se gli atomi di carbonio sono legati fra di loro e con gli atomi di idrogeno possiamo avere <span style=\"text-decoration: underline;\">catene lineari, ramificate o cicli<\/span>. Tutte molecole <span style=\"text-decoration: underline;\">apolari<\/span>.<\/p>\n<ul>\n<li><span style=\"text-decoration: underline;\">Quando proviamo a sciogliere queste molecole apolari in acqua succede che l&#8217;acqua tende ad estrometterle<\/span> (ricordate la tensione superficiale? le molecole di acqua &#8220;preferiscono&#8221; stare con altre molecole di acqua piuttosto che mescolarsi con molecole apolari, questo perch\u00e8 ogni volta che le molecole di acqua si mettono vicine fra loro si forma interazioni intermolecolari e questo libera energia).<\/li>\n<li>Poich\u00e9 l&#8217;atmosfera \u00e8 ricca di ossigeno e poich\u00e8 l&#8217;ossigeno \u00e8 molto reattivo i legami fra carbonio e idrogeno tendono a trasformarsi in legami carbonio-ossigeno liberando energia. <span style=\"text-decoration: underline;\">Tutte le molecole ricche di legami carbonio-idrogeno sono ricche di energia<\/span>. Un esempio? Il metano che utilizziamo per riscaldarci, gli idrocarburi che bruciamo nei motori delle nostre auto, i grassi che mangiamo..<\/li>\n<\/ul>\n<h3>Alcoli<\/h3>\n<p>Quando il carbonio fa uno o pi\u00f9 dei suoi quattro legami con un OH, vediamo cosa succede..<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"size-full wp-image-716 alignleft\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-14.45.49.png\" alt=\"Screen Shot 2016-02-09 at 14.45.49\" width=\"223\" height=\"340\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-14.45.49.png 223w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-14.45.49-197x300.png 197w\" sizes=\"auto, (max-width: 223px) 100vw, 223px\" \/><\/p>\n<\/div>\n<p>La molecola pi\u00f9 semplice che possiamo immaginare \u00e8 quella costituita da 1 carbonio, 3 idrogeni e un OH. Questa molecola, come vedete nel disegno affianco, risulta essere polare. Intorno all&#8217;ossigeno si concentra una parziale carica negativa (in rosso) mentre l&#8217;idrogeno legato a quell&#8217;ossigeno avr\u00e0 parziale carica positiva (in blu). Il resto della molecola \u00e8 apolare (in verde come il metano). Questa molecola che stiamo guardando si chiama metanolo e <span style=\"text-decoration: underline;\">tutte le molecole che come lei hanno un OH legato al carbonio le chiamiamo alcoli.<\/span><\/p>\n<p>Grazie al fatto di essere <span style=\"text-decoration: underline;\">polare<\/span> questa molecola potr\u00e0 interagire con altre molecole uguali a lei proprio come faceva l&#8217;acqua ed in fatti <span style=\"text-decoration: underline;\">a temperatura ambiente \u00e8 liquida<\/span>. \u00a0Lo vediamo bene nel disegno qui sotto dove sono rappresentate 3 molecole di un alcol, l&#8217;etanolo, che interagiscono fra loro a temperatura ambiente.<img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"size-full wp-image-717 alignright\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-14.04.30.png\" alt=\"Screen Shot 2016-02-09 at 14.04.30\" width=\"477\" height=\"235\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-14.04.30.png 477w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-14.04.30-300x148.png 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 477px) 100vw, 477px\" \/><\/p>\n<ul>\n<li>Quando mescoliamo un alcol con l&#8217;acqua, le <span style=\"text-decoration: underline;\">molecole di acqua e alcol si sciolgono insieme infatti possono tutte interagire le une con le altre grazie al fatto di essere polari<\/span>.<\/li>\n<li>In una molecola di alcol ci possono essere uno o pi\u00f9 gruppi OH. Si ottiene pi\u00f9 energia quando l&#8217;ossigeno sostituisce l&#8217;idrogeno nel legame con il carbonio che quando sostituisce un OH, per questo <span style=\"text-decoration: underline;\">gli alcoli contengono energia ma ne contengono meno degli idrocarburi<\/span>. L&#8217;etanolo pu\u00f2 essere un carburante, ma non buono come la benzina, gli zuccheri contengono molta energia, ma un po&#8217; meno dei grassi.<\/li>\n<\/ul>\n<h3>Aldeidi e chetoni<\/h3>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"size-full wp-image-721 alignright\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-16.51.33.png\" alt=\"Screen Shot 2016-02-09 at 16.51.33\" width=\"193\" height=\"126\" \/>Il carbonio fa 4 legami, fino adesso abbiamo visto casi in cui il carbonio fa 3 legami con l&#8217;idrogeno e 1 con l&#8217;OH, ma il carbonio pu\u00f2 anche fare 2 legami con altri carboni o idrogeni e due legami con una atomo di ossigeno, dando quello che chiamiamo un <span style=\"text-decoration: underline;\">carbonile<\/span><\/p>\n<p>La molecola che risulta, come vedete dalle immagini (accanto e sotto) \u00e8 polare, perch\u00e8 l&#8217;ossigeno \u00e8 pi\u00f9 elettronegativo (3,5) del carbonio (2,5)<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\" wp-image-722 alignleft\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/chetone.png\" alt=\"chetone\" width=\"191\" height=\"203\" \/><\/p>\n<ul>\n<li>se il carbonio \u00e8 legato a 1 idrogeno, 1 altro carbonio e 1 ossigeno chiamiamo aldeide<\/li>\n<li>se il carbonio \u00e8 legato a 2 carboni e 1 ossigeno chiamiamo chetone<\/li>\n<li><span style=\"text-decoration: underline;\">poich\u00e8 la molecola \u00e8 polare si scioglie bene in acqua<\/span><\/li>\n<li><span style=\"text-decoration: underline;\">avr\u00e0 meno energia degli idrocarburi e degli alcoli (infatti negli idrocarburi tutti e 4 i legami del carbonio possono essere sostituiti con un legame carbonio-ossigeno; negli alcoli 3 dei 4 legami del carbonio possono essere sostituito con legami carbonio-ossigeno; nei carbonili solo 2 dei 4 legami del carbonio possono essere sostituiti da legami carbonio-ossigeno, mentre gli altri 2 sono gi\u00e0 occupati con l&#8217;ossigeno)<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<\/div>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Acidi carbossilici<\/h3>\n<p>Nei <span style=\"text-decoration: underline;\">carbossili<\/span> (il nome suggerisce carbonio + ossigeno) 3 su 4 dei legami che il carbonio pu\u00f2 fare sono fra carbonio e ossigeno. Un esempio di molecola che contiene il\u00a0<span style=\"text-decoration: underline;\">gruppo carbossile<\/span> \u00e8 questo:<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"wp-image-726 alignleft\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-17.15.27.png\" alt=\"Screen Shot 2016-02-09 at 17.15.27\" width=\"363\" height=\"169\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-17.15.27.png 421w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-17.15.27-300x140.png 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 363px) 100vw, 363px\" \/><\/p>\n<ul>\n<li>vi ricordate l&#8217;etanolo che era CH3CH2OH, ovvero 2 carboni legati a idrogeni o altri carboni tranne in una posizione in cui c&#8217;era un legame fra carbonio e OH? Ecco abbiamo detto che quando queste molecole sono a contatto con l&#8217;atmosfera ricca di ossigeno l&#8217;ossigeno tende a sostituirsi all&#8217;idrogeno nei legami.. infatti se lasciate una bottiglia di vino aperta all&#8217;aria per un po&#8217;.. dopo un po&#8217; diventa aceto. Infatti il nome di questa molecola \u00e8 acido acetico e si tratta di una molecola di etanolo, che a contatto con l&#8217;aria, ha scambiato due legami carbonio-idrogeno con due legami carbonio-ossigeno<\/li>\n<li><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\" wp-image-727 alignright\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/aceticacidep.jpg\" alt=\"aceticacidep\" width=\"207\" height=\"181\" \/>anche queste molecole come potete vedere dall&#8217;immagine sotto (e forse ormai anche immaginare) <span style=\"text-decoration: underline;\">sono polari e pertanto si sciolgono bene in acqua<\/span><\/li>\n<li><span style=\"text-decoration: underline;\">l&#8217;energia in queste molecole \u00e8 davvero pochissima, 3 legami su 4 del carbonio sono gi\u00e0 con l&#8217;ossigeno, meno energia degli acidi carbossillici la ha solo l&#8217;anidride carbonica<\/span> (CO2 dove tutti e 4 i legami del carbonio sono con l&#8217;ossigeno)<\/li>\n<\/ul>\n<h3><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"wp-image-730 aligncenter\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-17.24.02.png\" alt=\"Screen Shot 2016-02-09 at 17.24.02\" width=\"522\" height=\"220\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-17.24.02.png 572w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-17.24.02-300x126.png 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 522px) 100vw, 522px\" \/><\/h3>\n<h3>Ammine<\/h3>\n<div class=\"page\" title=\"Page 10\">\n<div class=\"section\">\n<div class=\"layoutArea\">\n<div class=\"column\">\n<p>Il gruppo funzionale delle ammine e\u0300 il gruppo amminico NH2. Sono molecole in cui il carbonio fa uno dei suoi 4 legami con un azoto (simbolo N) che a sua volta \u00e8 legato con 2 idrogeni.<\/p>\n<ul>\n<li>anche queste molecole sono polari ma in questo caso nella zona intorno al gruppo amminico si ha una parziale carica positiva<\/li>\n<\/ul>\n<p>Nell&#8217;immagine qui sotto vi faccio vedere una molecola che a una estremit\u00e0 (quella sinistra) ha un gruppo amminico, mentre all&#8217;estremit\u00e0 opposta (quella a destra) ha un gruppo carbossilico. La molecola si chiama ammino-acido<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"size-full wp-image-733 aligncenter\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-17.39.27.png\" alt=\"Screen Shot 2016-02-09 at 17.39.27\" width=\"239\" height=\"188\" \/><\/p>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n<h3>Cosa abbiamo imparato<\/h3>\n<ul>\n<li><span style=\"text-decoration: underline;\">le molecole polari si sciolgono bene in acqua<\/span> perch\u00e8 possono interagire con le molecole di acqua che anche loro sono polari, basta che le porzioni delle molecole che hanno carica opposta si trovino vicine fra loro<\/li>\n<li><span style=\"text-decoration: underline;\">le molecole apolari vengono spinte fuori dall&#8217;acqua<\/span>, visto che quando le molecole di acqua interagiscono fra di loro si libera energia e avere delle molecole apolari in mezzo impedirebbe questo processo<\/li>\n<li>le molecole che contengono carbonio, nella nostra atmosfera ricca di ossigeno, hanno<span style=\"text-decoration: underline;\"> pi\u00f9 energia quando sono ricche di legami carbonio-carbonio e carbonio-idrogeno<\/span>, perch\u00e8 tendono a trasformarsi in legami carbonio-ossigeno liberando energia. Quando invece il carbonio \u00e8 gi\u00e0 legato all&#8217;ossigeno non avviene la reazione e non si libera energia<\/li>\n<li><span style=\"text-decoration: underline;\">le macromolecole biologiche sono costitute da varie dei gruppi funzionali che abbiamo visto associati fra loro in combinazioni diverse<\/span>, questo conferisce alle molecole finali propriet\u00e0 diverse a seconda delle combinazioni.<\/li>\n<\/ul>\n<p>Un esempio di queste associazioni di gruppi funzionali diversi o abbiamo gi\u00e0 visto sopra e si trattava degli aminoacidi, che sono i mattoncini che costituiscono le proteine.<\/p>\n<p>Qui sotto vi faccio vedere un altro esempio interessante di associazioni in una stessa molecola di gruppi con propriet\u00e0 diverse. Vi ricordate che i grassi sono ricchi di legami carbonio-idrogeno apolari e per questo non si sciolgono in acqua? Come fa allora il sapone a farli sciogliere? Beh i saponi sono costituiti da una estremit\u00e0 della molecola apolare come i grassi, l&#8217;altra estremit\u00e0 polare come l&#8217;acuqua, pertanto interagiscono con i grassi da una parte e con l&#8217;acqua dall&#8217;altra e cos\u00ec facendo portano i grassi a spasso in mezzo alle molecole di acqua!<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>il sapone ad esempio<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone size-full wp-image-729\" src=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-17.24.17.png\" alt=\"Screen Shot 2016-02-09 at 17.24.17\" width=\"782\" height=\"200\" srcset=\"https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-17.24.17.png 782w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-17.24.17-300x77.png 300w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-17.24.17-768x196.png 768w, https:\/\/sperimentando.com\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Screen-Shot-2016-02-09-at-17.24.17-624x160.png 624w\" sizes=\"auto, (max-width: 782px) 100vw, 782px\" \/><\/p>\n<h3>Cosa impareremo dopo di questo?<\/h3>\n<p>Ora siamo pronti per parlare delle macromolecole biologiche. Ciascuna delle grandi molecole che troviamo all&#8217;interno delle cellule \u00e8 composta da diversi dei gruppi funzionali che abbiamo visto fino adesso (idrocarburi, alcoli, carbonili, carbossili e ammine) combinati fra loro a formare molecole grandi e complesse di cui per\u00f2 possiamo immaginare le propriet\u00e0, visto che conosciamo le propriet\u00e0 delle parti che le compongono.<\/p>\n<div class=\"page\" title=\"Page 6\"><\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Studieremo insieme le molecole che si trovano dentro le cellule, quelle che caratterizzano la vita. 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